Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg2bQ80XK6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg2bQ80XK6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms