Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nrde2Q80XC6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrde2Q80XC6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.8 ms