Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AknaQ80VW7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AknaQ80VW7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 381 ms