Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WhrnQ80VW5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms