Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 316.7 ms