Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube3cQ80U95 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube3cQ80U95 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms