Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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