Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdp1Q7TSG2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms