Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dsg1bQ7TSF1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms