Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms