Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ckap2lQ7TS74 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms