Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms