Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms