Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg2Q7TMS5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcg2Q7TMS5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms