Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vma21Q78T54 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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