Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynmQ70IV5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms