Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NinlQ6ZQ12 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinlQ6ZQ12 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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