Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms