Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms