Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b3Q6UQ17 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms