Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.5 ms