Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms