Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms