Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvoplQ6PDF3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms