Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RgmaQ6PCX7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms