Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms