Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caskin1Q6P9K8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms