Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms