Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg2aQ6P4T0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms