Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slx4Q6P1D7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms