Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Paxip1Q6NZQ4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms