Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms