Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23ipQ6NZC7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23ipQ6NZC7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms