Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp140Q6NSQ5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms