Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms