Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms