Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sv2cQ69ZS6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms