Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrcc1Q69ZB0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms