Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk13Q69ZA1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms