Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brsk2Q69Z98 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms