Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms