Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc3Q64519 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sdc3Q64519 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sdc3Q64519 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc3Q64519 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sdc3Q64519 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sdc3Q64519 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Sdc3Q64519 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Sdc3Q64519 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Sdc3Q64519 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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