Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms