Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms