Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CochQ62507 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CochQ62507 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CochQ62507 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CochQ62507 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CochQ62507 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CochQ62507 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CochQ62507 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms