Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga3Q62470 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms