Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nptx1Q62443 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nptx1Q62443 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nptx1Q62443 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nptx1Q62443 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms