Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxa13Q62424 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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Hoxa13Q62424 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa13Q62424 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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