Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sprr1bQ62267 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms