Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms